施工合同中仅约定“工程造价由审计部门审计”，双方对工程造价未达成一致意见，承包人是否可以申请造价鉴定？

仅约定“工程造价由审计部门审计”的，不能确定是行政审计还是社会审计，属于约定不明，双方如不能对工程造价达成一致意见，承包人可以申请工程造价司法鉴定。

政府投资项目，施工合同约定“业主审计”作为结算依据，业主审计是否可以理解为政府审计？

以行政审计作为结算价款的依据，必须有施工合同的明确约定，约定不明确的，不能通过解释推定。因此，即使是政府投资项目，约定业主审计也不可以推定是以政府审计作为结算依据。